Protein–RNA interactions for Protein: Q96IW7

SEC22A, Vesicle-trafficking protein SEC22a, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22AQ96IW7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SEC22AQ96IW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SEC22AQ96IW7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SEC22AQ96IW7 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SEC22AQ96IW7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
SEC22AQ96IW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms