Protein–RNA interactions for Protein: Q96GD3

SCMH1, Polycomb protein SCMH1, humanhuman

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCMH1Q96GD3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCMH1Q96GD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SCMH1Q96GD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SCMH1Q96GD3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SCMH1Q96GD3 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SCMH1Q96GD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SCMH1Q96GD3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.7 ms