Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.63■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.6■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
LTV1Q96GA3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
LTV1Q96GA3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.5■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
LTV1Q96GA3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LTV1Q96GA3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
LTV1Q96GA3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.27■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.26■■■■□ 3.08
LTV1Q96GA3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC34.25■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
LTV1Q96GA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.1 ms