Protein–RNA interactions for Protein: Q96FV3

TSPAN17, Tetraspanin-17, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN17Q96FV3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
TSPAN17Q96FV3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSPAN17Q96FV3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TSPAN17Q96FV3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TSPAN17Q96FV3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TSPAN17Q96FV3 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms