Protein–RNA interactions for Protein: Q96FI4

NEIL1, Endonuclease 8-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEIL1Q96FI4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
NEIL1Q96FI4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
NEIL1Q96FI4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
NEIL1Q96FI4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NEIL1Q96FI4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms