Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY5

MVB12A, Multivesicular body subunit 12A, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVB12AQ96EY5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MVB12AQ96EY5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MVB12AQ96EY5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MVB12AQ96EY5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
MVB12AQ96EY5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MVB12AQ96EY5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms