Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
RCN3Q96D15 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RCN3Q96D15 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RCN3Q96D15 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RCN3Q96D15 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RCN3Q96D15 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RCN3Q96D15 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms