Protein–RNA interactions for Protein: Q96C24

SYTL4, Synaptotagmin-like protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 671 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYTL4Q96C24 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.84■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
SYTL4Q96C24 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.8■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.79■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.79■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.78■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.78■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.76■■■■□ 3
SYTL4Q96C24 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.75■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.72■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
SYTL4Q96C24 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
SYTL4Q96C24 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.59■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.59■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
SYTL4Q96C24 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
SYTL4Q96C24 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
SYTL4Q96C24 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.47■■■□□ 2.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms