Protein–RNA interactions for Protein: Q96AY2

EME1, Crossover junction endonuclease EME1, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EME1Q96AY2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
EME1Q96AY2 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
EME1Q96AY2 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
EME1Q96AY2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
EME1Q96AY2 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
EME1Q96AY2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms