Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RAB7BQ96AH8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RAB7BQ96AH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
RAB7BQ96AH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RAB7BQ96AH8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RAB7BQ96AH8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms