Protein–RNA interactions for Protein: Q969G9

NKD1, Protein naked cuticle homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKD1Q969G9 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NKD1Q969G9 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NKD1Q969G9 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NKD1Q969G9 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NKD1Q969G9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NKD1Q969G9 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms