Protein–RNA interactions for Protein: Q92581

SLC9A6, Sodium/hydrogen exchanger 6, humanhuman

Predictions only

Length 669 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A6Q92581 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
SLC9A6Q92581 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SLC9A6Q92581 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SLC9A6Q92581 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 566.6 ms