Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PHF3Q92576 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHF3Q92576 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHF3Q92576 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PHF3Q92576 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PHF3Q92576 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms