Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PALLDQ8WX93 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC33.48■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC33.47■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PALLDQ8WX93 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.42■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PALLDQ8WX93 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PALLDQ8WX93 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.92
PALLDQ8WX93 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PALLDQ8WX93 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
PALLDQ8WX93 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms