Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVZ7

RNF133, E3 ubiquitin-protein ligase RNF133, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF133Q8WVZ7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RNF133Q8WVZ7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RNF133Q8WVZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
RNF133Q8WVZ7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
RNF133Q8WVZ7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms