Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVS4

WDR60, WD repeat-containing protein 60, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR60Q8WVS4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
WDR60Q8WVS4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
WDR60Q8WVS4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
WDR60Q8WVS4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
WDR60Q8WVS4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
WDR60Q8WVS4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.9 ms