Protein–RNA interactions for Protein: Q8WTR4

GDPD5, Glycerophosphodiester phosphodiesterase domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD5Q8WTR4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDPD5Q8WTR4 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GDPD5Q8WTR4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GDPD5Q8WTR4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GDPD5Q8WTR4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GDPD5Q8WTR4 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GDPD5Q8WTR4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
GDPD5Q8WTR4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
GDPD5Q8WTR4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.55■■■□□ 2
GDPD5Q8WTR4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms