Protein–RNA interactions for Protein: Q8TD17

ZNF398, Zinc finger protein 398, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF398Q8TD17 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
ZNF398Q8TD17 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ZNF398Q8TD17 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ZNF398Q8TD17 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ZNF398Q8TD17 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZNF398Q8TD17 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZNF398Q8TD17 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms