Protein–RNA interactions for Protein: Q8TC56

FAM71B, Protein FAM71B, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71BQ8TC56 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
FAM71BQ8TC56 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
FAM71BQ8TC56 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
FAM71BQ8TC56 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
FAM71BQ8TC56 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
FAM71BQ8TC56 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms