Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MCFD2Q8NI22 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
MCFD2Q8NI22 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
MCFD2Q8NI22 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
MCFD2Q8NI22 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MCFD2Q8NI22 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms