Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH4

NUP37, Nucleoporin Nup37, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP37Q8NFH4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NUP37Q8NFH4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NUP37Q8NFH4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
NUP37Q8NFH4 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NUP37Q8NFH4 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NUP37Q8NFH4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms