Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM1

ZNF680, Zinc finger protein 680, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF680Q8NEM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ZNF680Q8NEM1 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF680Q8NEM1 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF680Q8NEM1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF680Q8NEM1 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
ZNF680Q8NEM1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms