Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEM0

MCPH1, Microcephalin, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCPH1Q8NEM0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
MCPH1Q8NEM0 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
MCPH1Q8NEM0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
MCPH1Q8NEM0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MCPH1Q8NEM0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MCPH1Q8NEM0 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms