Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G1

LINC00337, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00337, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00337Q8N6G1 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
LINC00337Q8N6G1 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
LINC00337Q8N6G1 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
LINC00337Q8N6G1 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LINC00337Q8N6G1 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms