Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
RYBPQ8N488 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
RYBPQ8N488 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RYBPQ8N488 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RYBPQ8N488 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.7 ms