Protein–RNA interactions for Protein: Q8N302

AGGF1, Angiogenic factor with G patch and FHA domains 1, humanhuman

eCLIP

Length 714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGGF1Q8N302 LSS-210ENST00000491729 2143 ntTSL 213.58□□□□□ -0.235e-22■■■■■ 64.3
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AGGF1Q8N302 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.16e-7■■■■■ 63.5
AGGF1Q8N302 DLGAP4-203ENST00000373907 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.386e-7■■■■■ 63.5
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AGGF1Q8N302 LINGO1-206ENST00000562933 567 ntTSL 520.87■□□□□ 0.934e-8■■■■■ 63.2
AGGF1Q8N302 LINGO1-203ENST00000559893 552 ntTSL 418.03■□□□□ 0.484e-8■■■■■ 63.2
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AGGF1Q8N302 LINGO1-202ENST00000557798 1035 ntTSL 317.59■□□□□ 0.414e-8■■■■■ 63.2
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AGGF1Q8N302 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 63.2
AGGF1Q8N302 LINGO1-212ENST00000567726 588 ntTSL 414.67□□□□□ -0.064e-8■■■■■ 63.2
AGGF1Q8N302 LINGO1-209ENST00000564472 522 ntTSL 412.69□□□□□ -0.384e-8■■■■■ 63.2
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AGGF1Q8N302 LINGO1-214ENST00000570216 571 ntTSL 58.92□□□□□ -0.984e-8■■■■■ 63.2
AGGF1Q8N302 LSS-208ENST00000474319 3601 ntTSL 211.21□□□□□ -0.615e-22■■■■■ 62.8
AGGF1Q8N302 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.472e-7■■■■■ 62.2
AGGF1Q8N302 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.712e-7■■■■■ 62.2
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AGGF1Q8N302 F7-203ENST00000444337 564 ntTSL 519.27■□□□□ 0.682e-10■■■■■ 62
AGGF1Q8N302 Z97192.2-201ENST00000393264 2379 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.122e-10■■■■■ 61.9
AGGF1Q8N302 C9orf3-215ENST00000478473 895 ntTSL 322.61■■□□□ 1.215e-11■■■■■ 61.5
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AGGF1Q8N302 C9orf3-206ENST00000428313 2288 ntTSL 1 (best)17.49■□□□□ 0.395e-11■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.075e-11■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 C9orf3-203ENST00000375315 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.325e-11■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 C9orf3-212ENST00000468164 849 ntTSL 512.82□□□□□ -0.365e-11■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 C9orf3-211ENST00000463372 919 ntTSL 311.28□□□□□ -0.65e-11■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 CNIH3-208ENST00000483512 968 ntTSL 215.26■□□□□ 0.032e-15■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 CNIH3-204ENST00000471578 876 ntTSL 510.05□□□□□ -0.82e-15■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 CNIH3-213ENST00000498126 778 ntTSL 38.78□□□□□ -12e-15■■■■■ 61.5
AGGF1Q8N302 PDE9A-214ENST00000460905 715 ntTSL 522.21■■□□□ 1.152e-7■■■■■ 61.4
AGGF1Q8N302 PDE9A-222ENST00000472401 431 ntTSL 38.74□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 61.4
AGGF1Q8N302 PDE9A-223ENST00000486902 794 ntTSL 28.74□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 61.4
AGGF1Q8N302 HSP90AB2P-202ENST00000602906 1277 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.991e-16■■■■■ 61.2
AGGF1Q8N302 HSP90AB2P-201ENST00000507090 2176 ntBASIC8.39□□□□□ -1.071e-16■■■■■ 61.2
AGGF1Q8N302 SHC2-205ENST00000590170 816 ntTSL 517.67■□□□□ 0.421e-7■■■■■ 60.9
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AGGF1Q8N302 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.156e-47■■■■■ 60.8
AGGF1Q8N302 DDT-205ENST00000428792 333 ntTSL 27.63□□□□□ -1.196e-47■■■■■ 60.8
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AGGF1Q8N302 RAP1GAP-205ENST00000374763 3334 ntTSL 1 (best) BASIC12.55□□□□□ -0.43e-8■■■■■ 60.7
AGGF1Q8N302 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.452e-7■■■■■ 60.6
AGGF1Q8N302 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.262e-7■■■■■ 60.6
AGGF1Q8N302 UCKL1-205ENST00000483710 524 ntTSL 310.1□□□□□ -0.792e-7■■■■■ 60.6
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AGGF1Q8N302 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 60.6
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AGGF1Q8N302 PDE9A-211ENST00000398232 1885 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 60.6
AGGF1Q8N302 PDE9A-204ENST00000335512 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.742e-7■■■■■ 60.6
AGGF1Q8N302 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.784e-8■■■■■ 60.5
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AGGF1Q8N302 EVL-207ENST00000553875 837 ntTSL 210.92□□□□□ -0.664e-8■■■■■ 60.5
AGGF1Q8N302 EVL-222ENST00000557153 590 ntTSL 46.62□□□□□ -1.354e-8■■■■■ 60.5
AGGF1Q8N302 EVL-208ENST00000553910 266 ntTSL 44.24□□□□□ -1.734e-8■■■■■ 60.5
AGGF1Q8N302 COL18A1-201ENST00000342220 3386 ntTSL 213.29□□□□□ -0.281e-14■■■■■ 60.5
AGGF1Q8N302 HERC2P3-204ENST00000426501 5995 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.441e-7■■■■■ 60.3
AGGF1Q8N302 LRP1-206ENST00000554118 418 ntTSL 27.73□□□□□ -1.172e-12■■■■■ 60.3
AGGF1Q8N302 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.538e-10■■■■■ 60.1
AGGF1Q8N302 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC13.74□□□□□ -0.215e-13■■■■■ 60
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AGGF1Q8N302 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.361e-12■■■■■ 59.7
AGGF1Q8N302 NBPF11-203ENST00000614506 5152 ntTSL 1 (best)17.03■□□□□ 0.321e-12■■■■■ 59.7
AGGF1Q8N302 NBPF11-202ENST00000614015 4630 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.55□□□□□ -1.21e-12■■■■■ 59.7
AGGF1Q8N302 NBPF11-204ENST00000614785 4343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.02□□□□□ -1.291e-12■■■■■ 59.7
AGGF1Q8N302 TSNARE1-203ENST00000518928 940 ntTSL 313.81□□□□□ -0.23e-8■■■■■ 59.6
AGGF1Q8N302 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.392e-7■■■■■ 58.9
AGGF1Q8N302 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 58.9
AGGF1Q8N302 ZNF444-210ENST00000592171 688 ntTSL 321.3■■□□□ 12e-7■■■■■ 58.9
AGGF1Q8N302 ZNF444-206ENST00000587664 568 ntTSL 321.04■□□□□ 0.962e-7■■■■■ 58.9
AGGF1Q8N302 ZNF444-204ENST00000587236 5565 ntTSL 216.83■□□□□ 0.282e-7■■■■■ 58.9
AGGF1Q8N302 RSU1-202ENST00000377911 955 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.479e-9■■■■■ 58.8
AGGF1Q8N302 RSU1-204ENST00000464074 1141 ntTSL 512.02□□□□□ -0.499e-9■■■■■ 58.8
AGGF1Q8N302 RSU1-201ENST00000345264 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.59e-9■■■■■ 58.8
AGGF1Q8N302 RSU1-203ENST00000377921 3919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.81□□□□□ -0.849e-9■■■■■ 58.8
AGGF1Q8N302 RSU1-205ENST00000602389 3639 ntTSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.869e-9■■■■■ 58.8
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