Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWV2

CNTN4, Contactin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN4Q8IWV2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CNTN4Q8IWV2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CNTN4Q8IWV2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CNTN4Q8IWV2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTN4Q8IWV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTN4Q8IWV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms