Protein–RNA interactions for Protein: Q86YW5

TREML1, Trem-like transcript 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML1Q86YW5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TREML1Q86YW5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TREML1Q86YW5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
TREML1Q86YW5 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TREML1Q86YW5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TREML1Q86YW5 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms