Protein–RNA interactions for Protein: Q86XT4

TRIM50, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM50, humanhuman

Predictions only

Length 487 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM50Q86XT4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
TRIM50Q86XT4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
TRIM50Q86XT4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
TRIM50Q86XT4 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
TRIM50Q86XT4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
TRIM50Q86XT4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
TRIM50Q86XT4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms