Protein–RNA interactions for Protein: Q86SS6

SYT9, Synaptotagmin-9, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT9Q86SS6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SYT9Q86SS6 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SYT9Q86SS6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
SYT9Q86SS6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SYT9Q86SS6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms