Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z7H5

TMED4, Transmembrane emp24 domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED4Q7Z7H5 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMED4Q7Z7H5 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMED4Q7Z7H5 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMED4Q7Z7H5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
TMED4Q7Z7H5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms