Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z4K8

TRIM46, Tripartite motif-containing protein 46, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM46Q7Z4K8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRIM46Q7Z4K8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRIM46Q7Z4K8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRIM46Q7Z4K8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRIM46Q7Z4K8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRIM46Q7Z4K8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms