Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTP6

MICAL3, [F-actin]-monooxygenase MICAL3, humanhuman

Predictions only

Length 2,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MICAL3Q7RTP6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MICAL3Q7RTP6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
MICAL3Q7RTP6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MICAL3Q7RTP6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
MICAL3Q7RTP6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
MICAL3Q7RTP6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
MICAL3Q7RTP6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
MICAL3Q7RTP6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
MICAL3Q7RTP6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms