Protein–RNA interactions for Protein: Q76G19

PDZD4, PDZ domain-containing protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD4Q76G19 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PDZD4Q76G19 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PDZD4Q76G19 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PDZD4Q76G19 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PDZD4Q76G19 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
PDZD4Q76G19 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PDZD4Q76G19 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms