Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZV65

FAM47E, Protein FAM47E, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM47EQ6ZV65 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
FAM47EQ6ZV65 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
FAM47EQ6ZV65 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
FAM47EQ6ZV65 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
FAM47EQ6ZV65 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FAM47EQ6ZV65 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FAM47EQ6ZV65 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms