Protein–RNA interactions for Protein: Q6PKC3

TXNDC11, Thioredoxin domain-containing protein 11, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TXNDC11Q6PKC3 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
TXNDC11Q6PKC3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TXNDC11Q6PKC3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TXNDC11Q6PKC3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TXNDC11Q6PKC3 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TXNDC11Q6PKC3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TXNDC11Q6PKC3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms