Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3R8

NEK5, Serine/threonine-protein kinase Nek5, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEK5Q6P3R8 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NEK5Q6P3R8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
NEK5Q6P3R8 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NEK5Q6P3R8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
NEK5Q6P3R8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms