Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY4

ZCCHC8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 707 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC8Q6NZY4 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZCCHC8Q6NZY4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZCCHC8Q6NZY4 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC8Q6NZY4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC8Q6NZY4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC8Q6NZY4 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms