Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
PRPF40BQ6NWY9 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
PRPF40BQ6NWY9 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
PRPF40BQ6NWY9 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
PRPF40BQ6NWY9 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
PRPF40BQ6NWY9 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.13■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
PRPF40BQ6NWY9 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
PRPF40BQ6NWY9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.5 ms