Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NANOGP8Q6NSW7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NANOGP8Q6NSW7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
NANOGP8Q6NSW7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NANOGP8Q6NSW7 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NANOGP8Q6NSW7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms