Protein–RNA interactions for Protein: Q6FI13

HIST2H2AA3, Histone H2A type 2-A, humanhuman

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST2H2AA3Q6FI13 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
HIST2H2AA3Q6FI13 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HIST2H2AA3Q6FI13 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HIST2H2AA3Q6FI13 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HIST2H2AA3Q6FI13 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms