Protein–RNA interactions for Protein: Q5YKI7

GGNBP1, Putative gametogenetin-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGNBP1Q5YKI7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GGNBP1Q5YKI7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GGNBP1Q5YKI7 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
GGNBP1Q5YKI7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
GGNBP1Q5YKI7 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
GGNBP1Q5YKI7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.6 ms