Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0Q7

USPL1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, humanhuman

Predictions only

Length 1,092 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USPL1Q5W0Q7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.96■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
USPL1Q5W0Q7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.91■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
USPL1Q5W0Q7 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC32.87■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.86■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC32.86■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.86■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.85■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.84■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.83■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
USPL1Q5W0Q7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.81■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.79■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.76■■■□□ 2.84
USPL1Q5W0Q7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
USPL1Q5W0Q7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.67■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
USPL1Q5W0Q7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.61■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
USPL1Q5W0Q7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms