Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU3

CHIC1, Cysteine-rich hydrophobic domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHIC1Q5VXU3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC43.73■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC43.72■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC43.71■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC43.7■■■■■ 4.59
CHIC1Q5VXU3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC43.69■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC43.68■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC43.67■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.67■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.66■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.58
CHIC1Q5VXU3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.63■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.61■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC43.61■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC43.61■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC43.6■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC43.59■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.58■■■■■ 4.57
CHIC1Q5VXU3 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC43.56■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC43.55■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.51■■■■■ 4.56
CHIC1Q5VXU3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.49■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.48■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC43.46■■■■■ 4.55
CHIC1Q5VXU3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC43.43■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC43.38■■■■■ 4.54
CHIC1Q5VXU3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC43.37■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.36■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC43.33■■■■■ 4.53
CHIC1Q5VXU3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms