Protein–RNA interactions for Protein: Q5U3C3

TMEM164, Transmembrane protein 164, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM164Q5U3C3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TMEM164Q5U3C3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TMEM164Q5U3C3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TMEM164Q5U3C3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TMEM164Q5U3C3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TMEM164Q5U3C3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms