Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SAMD5Q5TGI4 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
SAMD5Q5TGI4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
SAMD5Q5TGI4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAMD5Q5TGI4 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAMD5Q5TGI4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.3 ms