Protein–RNA interactions for Protein: Q5TB30

DEPDC1, DEP domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 811 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC1Q5TB30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
DEPDC1Q5TB30 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
DEPDC1Q5TB30 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
DEPDC1Q5TB30 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
DEPDC1Q5TB30 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms