Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJ09

SPANXN3, Sperm protein associated with the nucleus on the X chromosome N3, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPANXN3Q5MJ09 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
SPANXN3Q5MJ09 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
SPANXN3Q5MJ09 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
SPANXN3Q5MJ09 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPANXN3Q5MJ09 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPANXN3Q5MJ09 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms