Protein–RNA interactions for Protein: Q5H8C1

FREM1, FRAS1-related extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FREM1Q5H8C1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
FREM1Q5H8C1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
FREM1Q5H8C1 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FREM1Q5H8C1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
FREM1Q5H8C1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM1Q5H8C1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
FREM1Q5H8C1 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms