Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms