Protein–RNA interactions for Protein: Q53GA4

PHLDA2, Pleckstrin homology-like domain family A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDA2Q53GA4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PHLDA2Q53GA4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
PHLDA2Q53GA4 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PHLDA2Q53GA4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PHLDA2Q53GA4 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms